]> hackdaworld.org Git - physik/posic.git/blob - TODO.txt
visual atoms using moldyn func now, updated TODO, atom_match build by
[physik/posic.git] / TODO.txt
1 interstitial simulations
2 ************************
3
4   DOUBLECHECK with PARCAS !!!!
5
6   - visualize md.movie (converter tool - maybe good!)
7   - more checking ...
8
9 implement
10 *********
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12  - improve ins_m_atoms (merge to general ins_atoms function maybe)
13  - clean up mdrun
14  - config sanity checks
15  - introduce/improve fill command (multiple fills)
16
17  - check virial calc, where does the - come from?
18
19  - angular distribution
20  - structurfactoranalyze (see nordlund paper)
21
22  - filled atoms need atom attrib?!?!? or aattr pre prerun
23
24  - bond_analyze to dump xyz file of atoms
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26  - improve diff calc
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28  - make it parallel! (mpi/openmp) <- email to ralfu (asap)
29    * openmp: doch auf verlet listen (pointer problem!)
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31  - optimize code!
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33    * 6.56
34    * -> 6.16 (albe_potential_force_calc) unoptimized
35    * -> 7.05 first variable optimization
36    * -> 5.53 2nd variable mod (moving out of blocks)
37    * -> 5.12 source c files (orig albe) /wo float-store (otherwise 9.x)
38    * -> 5.00 source c, fpu_set() (orig albe)
39    * -> 5.04 source c, fpu_set() (albe fast) (same w -finline-functions)
40    * -> 4.55 source c, fpu(), albe orig, fast-math ;)
41    * -> 4.12 source c, fpu(), albe fast
42    * -> 4.06 source c, fpu(), albe fast, arch opts
43    * -> 3.54 ^ + c,d,h,gamma opts
44    * -> 3.50 ^ + static lists
45    * -> 3.37 source c, albe f, arch opts, c,d,h,gamma
46              + lowmem lists (test for bigger + atoms!)
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48    todo:
49     - listen ! estimate time
50     - more in fast (also think about -> 'type')
51     - algo! (though i don't believe!)
52     - inline
53     - openmp (num_thread copies of neighbour_i)
54       + pthreads (simultaneously!)
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56 simulation runs
57 ***************
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59 - cryst simulations: reasonable pctrl?
60 - even higher temperatures
61 - tctrl only in outer regions
62 - only 1 atom per timestep
63 - EXTENDED C-C cutoff
64 - different sized SiC prec in Si (4:5! diff temperatures)
65 - melting exps (both, anneal + interface method)
66 - interstitials:
67   - more interstitial combinations
68   - characterize interstitials by PCF, then inc temperature
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70 learn
71 *****
72
73 - ab initio / dft itself (find good docs)
74 - checkout abinit in the same time
75 - checkout thight binding
76 - of course md theory!
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78 write
79 *****
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81 - results >> thesis!
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