TODO.txt

   1 parcas
   2 ******
   3 more DOUBLECHECKs with PARCAS !!!!
   4
   5   * E_kin
   6   * x/y/z(t) of both
   7   * video of hex -> 100db
   8
   9 implement
  10 *********
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  12  - improve ins_m_atoms (merge to general ins_atoms function maybe)
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  14    * modified first: try rules to better distribute Si and C    ***
  15    * general cleanup
  16    * type 1 square, type 2 radius!
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  18  - clean up mdrun
  19  - config sanity checks
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  21  - anneal -> from current to T with rate R
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  23  - check virial calc, where does the - come from?
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  25  - angular distribution
  26  - structurfactoranalyze (see nordlund paper)
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  28  - filled atoms need atom attrib?!?!? or aattr pre prerun
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  30  - bond_analyze to dump xyz file of atoms
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  32  - improve diff calc
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  34  - pthreads:
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  36    * threads nur einmal oeffnen
  37    * verteilung auf laufende threads
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  39  - potentials:
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  41    * tersoff fast
  42    * meam
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  44  - optimize code!
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  46    * 6.56
  47    * -> 6.16 (albe_potential_force_calc) unoptimized
  48    * -> 7.05 first variable optimization
  49    * -> 5.53 2nd variable mod (moving out of blocks)
  50    * -> 5.12 source c files (orig albe) /wo float-store (otherwise 9.x)
  51    * -> 5.00 source c, fpu_set() (orig albe)
  52    * -> 5.04 source c, fpu_set() (albe fast) (same w -finline-functions)
  53    * -> 4.55 source c, fpu(), albe orig, fast-math ;)
  54    * -> 4.12 source c, fpu(), albe fast
  55    * -> 4.06 source c, fpu(), albe fast, arch opts
  56    * -> 3.54 ^ + c,d,h,gamma opts
  57    * -> 3.50 ^ + static lists
  58    * -> 3.37 source c, albe f, arch opts, c,d,h,gamma
  59              + lowmem lists (test for bigger + atoms!)
  60    * -> 3.31(36) ^ + inline v_calc
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  62    * -> 4.44 orig albe, lowmem, source c, arch opts
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  64    todo:
  65     - listen ! estimate time
  66     - more in fast (also think about -> 'type')
  67     - inline
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  69 simulation runs
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  72 - start with small nuclei and amorphous surrounding
  73 - tctrl only in outer regions
  74 - only 1 atom per timestep
  75 - melting exps (both, anneal + interface method)
  76 - interstitials:
  77   - sic ints (compare!)
  78   - more interstitial combinations
  79   - characterize interstitials by PCF, then inc temperature
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  81 learn
  82 *****
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  84 - ab initio / dft itself (find good docs)
  85 - checkout abinit in the same time
  86 - checkout thight binding
  87 - of course md theory!
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  89 write
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  92 - results >> thesis!
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