some checkins
[physik/posic.git] / moldyn.h
index 6310416..a1866a9 100644 (file)
--- a/moldyn.h
+++ b/moldyn.h
@@ -444,7 +444,8 @@ int moldyn_log_shutdown(t_moldyn *moldyn);
 
 int create_lattice(t_moldyn *moldyn,u8 type,double lc,int element,
                    u8 attr,u8 brand,int a,int b,int c,t_3dvec *origin,
-                   t_part_params *p_params,t_defect_params *d_params);
+                   t_part_params *p_params,t_defect_params *d_params,
+                   t_offset_params *o_params);
 int add_atom(t_moldyn *moldyn,int element,u8 brand,u8 attr,
              t_3dvec *r,t_3dvec *v);
 int del_atom(t_moldyn *moldyn,int tag);
@@ -522,6 +523,7 @@ int get_line(int fd,char *line,int max);
 
 int pair_correlation_init(t_moldyn *moldyn,double dr);
 int calculate_diffusion_coefficient(t_moldyn *moldyn,double *dc);
+int calculate_msd(t_moldyn *moldyn,double *msd);
 int calculate_pair_correlation_process(t_moldyn *moldyn,t_atom *itom,
                                        t_atom *jtom,void *data,u8 bc);
 int calculate_pair_correlation(t_moldyn *moldyn,double dr,void *ptr);