vasp_tools/stdvis

   1 #!/bin/bash
   2
   3 if [ -z "$1" ]; then
   4         echo "specify a directory ..."
   5         exit
   6 fi
   7
   8 if [ -z "$2" ]; then
   9         type="default"
  10 else
  11         type=$2
  12 fi
  13
  14 if [ "$type" != "disp" ]; then
  15
  16 for i in $1/video*; do
  17
  18
  19 # first unit cell in each direction without rotation
  20 if [ "$type" = "default" -o "$type" = "1" ]; then
  21 echo "type: 1 no rotation"
  22 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  23         -nll -0.20 -0.20 -0.50 -fur 1.20 1.20 1.20 \
  24         -b 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 \
  25         -c 0.8 -1.7 0.9 -L 0.5 -1.0 0.5 \
  26         -r 0.6
  27 fi
  28
  29 # first unit cell in each direction without rotation displaying mirrored atoms
  30 if [ "$type" = "1m" ]; then
  31 echo "type: 1 no rotation, mirrored"
  32 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  33         -nll -0.20 -0.20 -0.50 -fur 1.20 1.20 1.20 \
  34         -b 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 \
  35         -c 0.8 -1.7 0.9 -L 0.5 -1.0 0.5 \
  36         -r 0.6 -m 3.0 0.0 0.0 0.0 3.0 0.0 0.0 0.0 3.0
  37 fi
  38
  39 # three unit cells in each direction without rotation
  40 if [ "$type" = "3" ]; then
  41 echo "type: 3 no rotation"
  42 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  43         -nll -0.20 -0.20 -0.20 -fur 3.20 3.20 3.20 \
  44         -b 0.0 0.0 0.0 3.0 3.0 3.0 \
  45         -c 2.3 -3.7 2.4 -L 1.5 -1.0 1.5 \
  46         -r 0.6
  47 fi
  48
  49 # unti cell 3,0,2
  50 if [ "$type" = "3x2z" ]; then
  51 echo "type: 3x2z no rotation"
  52 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  53         -nll 1.8 -0.2 0.8 -fur 3.20 1.20 2.20 \
  54         -b 2.0 0.0 1.0 3.0 1.0 2.0 \
  55         -c 2.3 -3.7 2.4 -L 1.5 -1.0 1.5 \
  56         -r 0.6
  57 fi
  58
  59 # first unit cell rotated by 45 degrees about z-axis
  60 if [ "$type" = "1r" ]; then
  61 echo "type: 1 rotated"
  62 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  63         -nll -0.20 -0.70 -0.20 -fur 2.00 0.70 1.20 \
  64         -c -0.5 -1.5 0.9 -L 1.0 0.0 0.5 \
  65         -r 0.6
  66         #-b 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 \
  67 fi
  68
  69 # first unit cell rotated by 45 degrees displaying mirrored atoms
  70 if [ "$type" = "1rm" ]; then
  71 echo "type: 1 rotated, mirrored"
  72 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  73         -nll -0.20 -0.20 -0.20 -fur 1.20 1.20 1.20 \
  74         -b 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 \
  75         -c 0.8 -1.7 0.9 -L 0.5 -1.0 0.5 \
  76         -r 0.6 -m 2.0 -2.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 0.0 3.0 \
  77         -A 193 1.9
  78 fi
  79
  80 # three unit cells (rotated) in each direction displaying mirrored atoms
  81 if [ "$type" = "3rm" ]; then
  82 echo "type: 3 roted, mirrored"
  83 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
  84         -nll -0.20 -0.20 -0.20 -fur 3.20 3.20 3.20 \
  85         -b 0.0 0.0 0.0 3.0 3.0 3.0 \
  86         -c 1.3 -3.7 2.4 -L 1.5 -1.0 1.5 \
  87         -r 0.6 -m 2.0 -2.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 0.0 3.0
  88 fi
  89
  90 ./ppm2avi $i
  91
  92 done
  93
  94 else
  95
  96 # 100 db in type 1 sc (insdide sc)
  97 for i in $1/video/atomic_conf_*.xyz; do
  98         displace=`echo $i | awk -F_ '{ print $7 }' | sed 's/\.xyz//'`
  99         echo "$i $displace ..."
 100 ./visualize -w 640 -h 480 -d $i \
 101         -nll -0.20 -0.20 -0.50 -fur 1.20 1.20 1.20 \
 102         -b 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 1.0 \
 103         -c 0.8 -1.7 0.9 -L 0.5 -1.0 0.5 \
 104         -r 0.6 -B 0.1 -D $displace -m 2.0 -2.0 0.0 2.0 2.0 0.0 0.0 0.0 3.0
 105 done
 106
 107 fi
 108
 109 #mplayer $1/video/md.avi
 110