vasp_tools/pc_script

   1 #!/bin/bash
   2
   3 if [ ! -d $1 ]; then
   4         echo "not a valid directory ..."
   5         exit
   6 fi
   7
   8 if [ ! -f $1/OUTCAR ]; then
   9         echo "no vasp data found in $1 ..."
  10         exit
  11 fi
  12
  13 if [ ! -d $1/video ]; then
  14         echo "no video directory found ..."
  15         echo "forgot to run outcar2moldyn?"
  16         exit
  17 fi
  18
  19 echo
  20 echo "WARNING !!!!"
  21 echo "-> reading in sx sy and sz is not correct ..."
  22 echo "WARNING !!!!"
  23 echo
  24
  25 line=`sed -n -e '/length of/,/FORCES/p' $1/OUTCAR | grep ^\ \ \  | tail -1`
  26
  27 sx=`echo $line | awk '{ print $1 }'`
  28 sy=`echo $line | awk '{ print $2 }'`
  29 sz=`echo $line | awk '{ print $3 }'`
  30
  31 file=`ls $1/video/atomic_conf*.xyz | tail -1`
  32
  33 echo "running on $file using $sx $sy $sz ..."
  34
  35 ./pc_calc $file $sx $sy $sz | grep ^pc | \
  36         awk '{ print $2 " " $3 " " $4 " "$5 }' > pc.txt
  37
  38 echo "done"
  39